适时采收和认真细致地分级是提高真姬菇商品价值的重要环节。真姬菇长到一定标准时，即菌盖1.5～4厘米时就应及时采收。采收时，一手按住菌柄基部培养料，一手握住菌柄，轻轻地将整丛菇拧下。第一潮菇采收完后，及时清除料面上残留的菌柄、碎片和死菇，并进行补水管理。大约15天左右第二潮菇蕾就会形成，如前所述继续管理，就可采收第3、4潮，有的可采收第5潮菇。
一般真姬菇可分为3个等级。一级菇，菌盖直径1.5～2.5厘米，菌柄长度4厘米以下；二级菇，菌盖直径2.6～3.5厘米，菌柄长4厘米以下；三级菇，菌盖直径3.6～4.5厘米，菌柄长4厘米以下。
